张翠山（吴镇宇 饰）携妻及子张无忌（李连杰 饰）从孤岛出发赶去给其师父贺百岁大寿的途中，被人暗算，张无忌中寒冰掌。在武当山，张翠山和妻子被各大门派逼迫致死，张无忌也不再能练习武功，只能靠张三丰每日所输真气得以残活。张三丰的举动引来宋青书（邹兆龙 饰）的妒忌，他联合了峨眉女弟子周芷若（黎姿 饰）共同对付张无 忌。明教圣女小昭（邱淑贞 饰）令张无忌改变命运，使其先在断崖上遇到高人治好体内寒冰毒、学会九成“九阳神功”，又在明教禁地练得“乾坤大挪移心法”。得知蒙古郡主赵敏（张敏 饰）设计令江湖六大派围攻光明顶想歼灭明教时，张无忌决意为拯救明教赴汤蹈火。

　　明朝严世藩（罗乐林）为排除异己杨继盛，遂派出豢养的杀手“十三死肖”往杨家斩草除根。杨家乃武林世家，十二死肖接连失手，藩最后唯有派出最厉害的第十三死肖“人”（钱小豪）执行任务。适盛之子云清（张兆辉）有事要赴武当，杨家无人能敌“人”之武功，惨遭灭门。当“人”手刃身怀六甲的杨家媳妇时，天刚正亮，就在此刻“人”发生极大变化！原来“人”只能于夜间杀人，天亮便复现人性。“人”在日出那瞬间杀人，良心发现痛不欲生，决背叛藩流浪江湖。藩恐“人”成后患，下令余下死肖追杀之。“人”幸得清仗义相助，得以歼灭所有死肖，清更不记旧仇助“人”解除毒咒回复常态。“人”为报答清，决以死赎前罪……

清雍正元年，大将军年羹尧平息青海叛乱后回到京都。皇帝担心握有军权的年将军功高盖主，以莫须有罪名赐死这位战功显赫的大臣。皇帝的心腹肃仁亲王接受密令，率领御林军统领常玉岗等深夜围攻年府，欲满门抄斩。常玉岗钦佩年将军，愿冒死违抗圣命救出年家后代年戟、年霞飞。年将军夫妇将一对玉蝴蝶挂在两个孩子的胸前，作为成人后兄妹相认的证物，然后夫妻二人饮毒酒而死。

东瀛霸主绝无神挟持中原皇帝逼其让位，更要处决身中巨毒的无名、步惊云为首的一众武林“叛党”。行刑之日，聂风及时赶到，在一众武林人士的舍命死战下，聂风、步惊云及无名等人得以逃脱。为打败绝无神，聂风……

内详

电影分为两个单元。《桃花传奇》：中原少女西门无恨（杨钧钧 饰）一直对自己的身世耿耿于怀，为了弄清楚事件的真相，她冒充了当年叱咤风云如今早已隐退江湖的楚留香（刘德凯 饰），成功使得退出江湖已久的楚留香再度出山，并且最终发现西门无恨就是他的女儿。《西门无恨》：曾经，楚留香爱上了麻女圣教的圣女张洁洁（杨钧钧 饰），两人因而遭到了魔火宫的少宫主的追杀。在生下了西门无恨后，张洁洁含恨自尽，西门无恨则被带往了扶桑。西门无恨苦练武功，发誓要为母亲报仇，尽管她成功潜入了麻衣圣教，却不敌邪恶阴险的麻十三（任世官 饰），身陷险境。

明代皇室的密室，内阁大学士取出先帝钦命摄政王的遗诏，准备在文武大臣中当众宣布，揭晓五位皇叔中谁被钦定为摄政王。突然，一蒙面怪客骤至，刺死大学士，夺走遗诏。京城总捕头铁中杰追捕时被毒箭射中，临死前告诉弟弟铁中英，这是丹顶红毒。铁中英奉命侦破此案。文武双全、有希望成为摄政王的济州王在狩猎时，被不知从何而来的毒箭射死，用的毒又是丹顶红。好色的汝南王在一次寻花问柳中，亦被毒箭所害，中的毒仍是丹顶红。端州王则认为这是与王爷们有杀父之仇的江湖女杰韩氏三姐妹所为，遂派兵捣毁了她们的山寨白马山庄，并抓了大姐韩飞云。韩依云、韩彩云前去劫狱，遭到埋伏，危急之时，幸得蒙面怪客所救。飞云在狱中受尽凌辱和折磨，最后惨死于酷刑之下，依云姐妹得知飞云被害，决意报仇，刺杀端州王。行刺时，铁中英赶到，发现刺客竟是他少时青梅竹马的彩云，而死的王爷不是端州王，却是洛阳王。五位王爷只剩下长沙王和端州王了，主凶究竟是谁？案情扑朔迷离。

外传黑旋风二弟被杀，说是白云飞之子所为。白云飞之子生性贪婪好色，奸淫掳掠，无所不为，人人得而诛之！于是黑旋风前来白家报仇，一条蛇也来帮打，将白云飞打死，并送尸白家。白家二兄弟联合起来，费尽辛苦将黑旋风一党连同一条蛇通通杀死，报此大仇。

高丽国王供奉大唐皇帝的镇国之宝——汉血玉马，不幸被江南四大盗劫去。四盗因无法分赃，遂决定在赌城设局，赢者独占玉马。消息一出，各路人马纷纷出动，意欲夺宝。为此展开了一场又一场血腥大战。

　　在恋人（张曼玉）负气嫁给兄长的当晚，欧阳锋（张国荣）黯然离开白陀山，走进沙漠某个小镇，成为一名杀手中介人。他的朋友、风流剑客黄药师（梁家辉）每年都来小镇与他畅饮，酒话里有关白陀山的消息令他忘却往事的念想渐次演变成自欺行为。　　黄药师只是表面风流。他迷恋好友“盲武士”（梁朝伟）的妻子桃花（刘嘉玲），后者在丈夫死后，永远地离开了他；而对迷恋他的女人慕容嫣（林青霞），他又不愿兑现曾经随口说出的承诺，这使得慕容嫣迷失于自己的身份中。与欧阳锋构成短暂“买凶杀人”关系的洪七（张学友）、村姑（杨采妮）等人，也都有一段只有他们自己才知、不愿回首的痛苦过往。